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非標記定量（Label free）蛋白質組學
作者:管理 發布時間:2022-06-24 14:02:05
定量蛋白質組學是蛋白質組研究的重要內容，通過對基因表達產物——蛋白質的定量分析，以了解基因在不同的生理、病理和逆境條件下的表達情況。近年來，隨著非凝膠技術的發展，“鳥槍法”蛋白質組學（“Shotgun”proteomics）技術，特別是多維蛋白質鑒定（Multidimensional Protein Identification，MudPIT）已成為研究復雜生物樣本中大規模蛋白質表達和定性和定量分析的強有力工具。
在非標記策略的定量模型中，主要涉及兩種不同的算法：其一，以肽段的色譜峰積分面積為基礎，通過比較一對生物樣品中相對應到蛋白質酶解多肽的色譜積分面積而得到兩者的相對豐度；其二，以肽段被質譜檢測的計數為基礎，通過歸一化來表征被檢測蛋白質的相對豐度。非標記技術認為肽段在質譜中被捕獲檢測的頻率（Counts）與其在混合物中的豐度成正相關，因此蛋白質被質譜檢測的計數反映了蛋白質的豐度，通過適當的數學公式可以將質譜檢測計數與蛋白質的量聯系起來，從而對蛋白質進行定量。
